Voordat een HardDisk van een FileSystem voorzien kan worden, moet(en) er één of meerdere Partities worden aangebracht.

Om parities te manipuleren (toevoegen en verwijderen) beschikken de meeste besturingssystemen over een programma met de naam fdisk. Hieronder zal alleen de fdisk variant die meestal bij Linux wordt geleverd worden besproken. In de praktijk blijkt dit de betrouwbaarste fdisk te zijn. Dit in tegenstelling tot bijvoorbeeld de fdisk van Microsoft die van erbarmelijk slechte kwaliteit is en waarmee gegevensverlies meer regel dan uitzondering is!

Het fdisk programma kent vergeleken met veel andere programma's relatief weinig commandline opties. Dat komt omdat fdisk interactief is. Om fdisk te starten heeft het alleen de naam van de harddisk nodig die gemanipuleerd moet worden, bv:

fdisk /dev/hda

WAARSCHUWING: Bij ondeskundig gebruik kan fdisk tot gegevensverlies leiden!

Na het starten van fdisk verschijnt de fdisk prompt:

Command (m for help): _

Op deze fdisk prompt kunnen commando's worden gegeven. Een overzicht van deze commando's kan in beeld worden gebracht met "m" (Menu), gevolgd door Enter. Met het "p" (Print) wordt een overzicht gegeven van de reeds bestaande partities. Om een nieuwe partitie aan te maken wordt het "n" (New) commando gebruikt. Fdisk zal dan vragen om enkele gegevens zoals grootte van de partitie en waar de partitie moet beginnen. Om het type te wijzigen wordt het "t" commando gebruikt. Een overzicht van alle beschikbare typen kan worden opgevraagd met het "l" (List know partition types) commando. Voor het verwijderen van een partitie is het "d" (Delete) commando beschikbaar.

Sommige corrupte besturingssystemen kunnen alleen gestart worden als de partitie waar ze op staan als "actief" gemarkeerd is. Hiervoor is het "a" (Activate partition) commando beschikbaar. Soms kan het nodig zijn om op een lager niveau de partitie tabel te bewerken. De commando's hiervoor zijn in een apart menu opgenomen dat kan worden benaderd met het "x" (eXtra) commando.

De wijzingen worden niet direct uitgevoerd. Pas na het geven van het "w" (Write) commando worden de wijzigingen opgeslagen. Om fdisk te verlaten zonder de wijzigingen op te slaan is het "q" (Quit) commando. Na het wijzigen van de partitie tabel moet de computer opnieuw worden opgestart.

Een alternatief voor fdisk is cfdisk dat door veel mensen als eenvoudiger wordt bestempeld.